Все классы без исключения наследуются от Object. Поэтому неограниченный wildcard <?> всегда подразумевает его в качестве верхней границы. Оба этих типа в рантайме сотрутся в List<Object>, функциональных отличий нет.

Не смотря на одинаковое поведение, существует одно синтаксическое различие. Неограниченный дженерик – reifiable тип. Это значит, что он представлен в рантайме. Такой тип можно использовать в операторе instanceof, тогда как синтаксическая конструкция x instanceof List<? extends Object> приведет к ошибке компиляции.

Тип List без параметра имеет больше отличий, мы уже говорили о них ранее, в публикациях про raw types и проблему heap pollution.